Gruel-Fayer a pour mission de distribuer et de mettre en marché des semences et des produits de protection des plantes. La spécialisation de cette dernière activité fait de Gruel-Fayer un logisticien de produits agro-pharmaceutiques.

Ainsi, Gruel-Fayer est soumis à la législation sur les Installations Classées pour la Protection de l'Environnement (ICPE), qui impose le respect strict d'exigences réglementaires fortes.
Les établissements de Châteaubourg et d'Estillac sont classés SEVESO seuil haut.

Gruel-Fayer est tenu de mettre en place une Politique de Prévention des Accidents Majeurs (PPAM). Au-delà des mesures techniques, un effort particulier est porté sur l'organisation de l'entreprise au quotidien. Cette démarche se concrétise au travers d'un Système de Gestion de la Sécurité qui s'appuie sur d'importants moyens humains et matériels.